发病机理：病毒经口鼻感染，侵入小肠后，在小肠绒毛吸收上皮增殖，损伤细胞器，继而出现细胞功能障碍，因线粒体肿胀引起细胞数量减少，营养物质吸收不良，这是绒毛萎缩前发生腹泻的主要原因，随着病程的发展，吸收上皮损伤逐渐加重，直到上皮脱落，形成绒毛萎缩，吸收面积减少，引起营养物质吸收显著降低，蛋白、糖、脂肪不能彻底分解，使肠内物质腐败发酵。刺激肠末梢感受器，蠕动增强面引起腹泻，由于肠内碱性物质大量排出，引起酸中毒、自体中毒、脱水和贫血，以致因病毒血症衰竭死亡。
病理变化：和典型的传染性胃肠炎十分相似，小肠绒毛缩短，上皮细胞核浓缩、破碎、胞浆呈强嗜酸性变性，坏死性变化，致使绒毛显著萎缩。眼观病变仅限于小肠，有别于传染性胃肠炎，肠管膨胀扩张充满黄色液体，肠壁变薄，肠系膜充血，肠系膜淋巴结肿胀。
防治措施：首先要加强饲养管理。禁止从疫区引进种猪，外地引进的带菌猪必须隔离观察；做好猪舍周围的卫生工作和保持母猪和产房的清洁干燥；做好全进全出和冬季的驱寒保暖工作。
疫苗防疫。每年冬天10月份～11月份母猪、种公猪全群接种传染性胃肠炎－流行性腹泻二联苗，每头1头份，经产母猪产前一个月接种1头份/头，后备母猪产前40天和20天分别接种1头份/头。仔猪断奶后10天~15天接种一次。疫苗注射用后海穴注射效果比颈部肌肉注射好。
抗生素疗法 。猪饮用口服补液盐溶液，配方为1000毫升水中加20克葡萄糖、3.5克氯化钠、2.5克碳酸氢钠、1.5克氯化钾。全群用药。
拌料药物治疗。加：佳免1.51千克＋鼎泰1千克＋维多康500克+葡萄糖10千克，连用一周。个别病情特别严重的小猪可采用抗生素加补液盐灌服，严重的母猪采用静脉注射的方法给药。
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