北京养猪育种中心经过多年的发展，已经建成一套完整的四级种猪良种繁育体系。四级种猪良种繁育体系由原种场（核心群）、扩繁场（繁殖群）和商品场（生产群）以及终端商品猪饲养场组成，整个繁育体系的重点是原种场（核心群）。繁育体系的四级总体目标一致，就是为顾客提供优质、安全、绿色猪肉，但各自的性质不同，生产任务不同，从上到下，呈金字塔形状排列，优秀基因流的方向同样从金字塔的顶端指向底端，不能反向，终端商品猪的品质是检验整个繁育体系最好的依据。
原种场（核心群） 原种场处于种猪繁育体系的金字塔塔尖，主要任务是做好品种规划和育种方案，根据育种方案进行纯种选育，开展种猪性能测定，以期获得最大的遗传进展。原种场优秀后代可以更新核心群种猪或者为扩繁群提供后备公母猪等。
SPF种猪选育场 北京养猪育种中心所属北京SPF育种管理中心，是目前全国唯一专门从事SPF猪系统开发研究的种猪企业，经过多年的研发，形成了集SPF猪实验室监测、仔猪获取、隔离寄养、性能测定、SPF猪核心群选育和扩繁以及相关配套技术标准等为一体的完整的SPF猪应用技术体系。
1.SPF种猪核心群选育
直接参加选育和测定的优秀个体组成的群体称为核心群。核心群是为整个种猪繁育场提供后备种猪的，核心群的质量关系到整个猪场整体的生产性能和种猪场的长期发展战略。育种的最终目标定位在生产群，而不是核心群(Merks,1989；Fewson,1994)，但是只有紧紧围绕核心群的选育展开工作，我们的最终目标生产群的生产性能才会提高。
(1)核心群组建 核心群的数量：有研究表明，核心群的数量占整个基础母猪群体的30％左右最为适宜。核心群种猪选择的基本标准是：种公猪选留要求品种特征明显，肢蹄结构优秀，背臀肌肉丰满，生殖系统发育正常，收腹良好，性欲好，根据测定评估数据和现场观察来决定。最后进入核心群的种公猪必须是经过生产性能测定过的种猪，选择该血缘最优秀的种公猪进入公猪站，加速猪群的整体遗传进展。种母猪选留要求品种特征明显，肢蹄结构优秀，生殖系统发育正常，奶头数量足够，并排列整齐，发育良好，根据测定评估数据和现场观察来决定。核心群母猪：应该整理分析整个育种场母猪的产仔性状，在进行统计分析后，只有那些产仔数在猪群整体平均数一倍标准差以上的种猪才有机会进入核心群。无论种公猪或者种母猪，都要在同一血缘内比较后，选择最优秀者留种，种公猪尤其要经过测定比较后才能决定选留。
(2)核心群的更替 核心群的管理应该是一个动态的、平衡的系统，对于这个系统既要是动态的，又要有一定的稳定性。每经过一段时间，利用遗传评估软件对整个猪群进行一次系统的评估，按照选择的指数对种猪进行一次评估，再根据实际生产中的具体表现，决定哪些种猪应该进入核心群，哪些种猪应该离开核心群，使整个核心群的生产性能总保持较高的状态，这样可为后备种猪的选择打下坚实的基础。
2.种猪性能测定站
北京养猪育种中心种猪性能测定站拥有64套法国进口的ACEMA48自动测定系统，是全国最大的种猪性能测定站，承担着核心群后备种公猪以及配套终端商品猪的测定任务，为加速种猪的遗传奠定了基础。
3.SPF种公猪站
SPF种公猪站是农业部北方地区最大的种公猪站，是北京养猪育种中心种猪良种繁育体系的优秀公猪基因库和精子库，通过人工授精技术，公猪的优秀基因可以迅速地向种群、扩繁群和商品群中快速传播，加速种群的遗传进展，降低频繁引种造成的疾病传播。
北京养猪育种中心形成了“SPF种猪选育场———种猪性能测定站———SPF种公猪站”三位一体的原种核心群选育体系，推动了整个种猪良种繁育体系的建设。从核心群内选择健康、性能优越的青年公猪进入种猪性能测定站进行性能测定，通过应用GPS软件-BLUP法进行遗传评估，充分利用该个体本身及其父母、同胞等所有信息，提高了估计育种值的准确性，然后计算选择指数，最后根据体形外貌评分和选择指数，把性能优越的1%~5%的公猪补充到SPF种公猪站，通过人工授精的方式使得优良基因在群体内快速传播，提高整个群体优秀基因频率和基因型频率，加速群体的遗传进展。
扩繁场（繁殖群） 扩繁场位于整个繁育体系金字塔结构的中间层，具有承上启下的作用，是连接原种场和商品场的纽带。扩繁场的主要任务是扩繁纯种母猪和生产杂种公母猪。扩繁场生产的杂种公母猪的目标方向各不相同：公猪生产性能的主要目标是生长速度快、瘦肉率高以及 饲料转化率高等；母猪生产性能的主要目标是繁殖性能好、适应能力和抗病力强等。繁殖群更新的后备猪必须来自核心群，不允许接受商品场的猪只。
商品场（生产群） 商品场位于整个繁育体系金字塔结构的底层，主要功能是按照杂交计划的要求，组织好父母代的杂交，生产杂优猪。商品场的主要工作是提高猪群的生产效率，向测定站提供优秀的商品猪进行测定，以检验育种计划、育种目标等的实现情况；按照统一的育种计划，使用核心群和扩繁场提供的终端父本，或者种公猪站优秀公猪的精液。
终端商品猪饲养场 终端商品猪饲养场仅仅饲养商品猪，它是整个繁育体系的最终结果和产品，最终要接受市场和消费者的考核，也是整个 种猪繁育体系最终价值的体现。北京养猪育种中心终端商品猪饲养场位于河北省承德市，走“公司+农户”的产业化发展模式，目前已经取得可喜的成果。
北京养猪育种中心建立了完善的四级 种猪繁育体系，是集种猪生产、科研、育种、销售以及培训服务为一体的大型种猪企业，在实践中摸索着建设符合中国国情和企业发展条件的种猪四级繁育体系，对同行和养猪界具有一定的借鉴意义。
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