高芳认为，目前新疆目标价格政策进展总体比较顺利，市场定价机制已经开始发挥作用。但是，经过2014年新疆棉花的收购、销售、补贴等环节的执行，改革存在的问题也显现出来了。“核查棉花面积要花费巨大的人工成本，交售数量的核查也存在不确定因素。”业内棉花专家李伟分析。
中央财政给主产棉省的补贴依据为国家统计局确定的棉花产量，补贴方式由各省自主决定，可选择按面积或按产量补贴，补贴资金要求专户管理、封闭运行、专款专用，不得预留、挤占和挪用，确保补贴落实到棉农手中。
目前国家相关政府部门正在安排后期的补贴发放工作。在2014年12月23日举行的棉花目标价格改革试点工作新闻通气会上，新疆自治区财政厅经建处副处长胡方毅向媒体表示，国家发改委和财政部正在对棉花补贴标准进行研究制定，棉花面积补贴标准和交售量补贴标准将于2015年1月和2月公布。
随着新疆棉花目标价格补贴发放时间的迫近，后续的补贴进度和金额备受关注，棉农普遍期望能够尽快拿到足额补贴。高芳说，不管是新疆还是内地，最后如何发、发多少，关键是能够完全落实到棉农手中，不给违规操作骗补行为以可乘之机，棉花目标价格补贴政策才会持续健康运行下去。
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