经过近30年的迅猛发展，中国动物生产行业已经进入一个平台期，各种问题、矛盾凸显，产品同质化、饲料原料紧缺、价格普涨、养殖成本高企、养殖积极性受到打击、滥用抗生素、食品安全受到威胁、环境污染日趋严重，这些无不时刻考验着整个行业的每一根神经。如何改变现状，推动动物生产业和饲料企业转型升级，有效缓解原料紧缺、健康养殖、环境污染等公共问题，值得我们深入思考!
生物发酵，不是一个新名词，作为一个可以提高饲料转化率、保护动物肠道健康、降低粪氮排泄、改善养殖环境等的技术手段，近几年，受到不少饲料企业和饲料添加剂企业的关注。酶制剂、益生菌、发酵垫料(发酵床)、发酵原料(发酵饲料)等均已成为动物生产领域中不可或缺的产品。未来，我们有理由相信，饲料的机械加工和生物发酵将并存于饲料生产和动物养殖中，但如何整合生物发酵和机械加工，让生物发酵更进一步地贴近养殖终端，使之能够成为促进饲料企业转型，养殖体系受益，社会环境改善，食品更加健康安全的关键技术纽带，还有很多方面需要论证。
1、 动物生产存在的问题——养殖不规范、污染严重、抗生素滥用
现在，散养户饲养水平、饲养条件较差，疫病防治意识薄弱，防疫措施不够完善，活禽交易市场不规范，卫生条件、通风、消毒等措施不严密，都导致了动物疾病的增加，尤其是人畜共患病的发生更是加大了人们对动物安全、食品安全的恐惧，如禽流感H7N9、H5N1 病毒的蔓延，都是近年来影响生命安全的畜产品带给社会的危害。随着规模化、集约化动物养殖业的发展和动物及其产品的频繁流通，动物疾病尤其是传染性疾病越来越多，危害日趋严重。
与散养相比，集约化养殖在遗传育种、饲料营养、疫病防治、环境控制、饲料转化率、生产效率、标准化生产、经营管理、规模效益等方面都具有无可比拟的优势，受资源状况、经济条件等因素制约，我国规模化养殖主要集中在城镇附近和经济相对发达的地区，随着经济的发展和人们生活水平的不断提高，人们对安全健康畜产品需求的增长已成为食物需求增长的主体。但是动物养殖集约化经营在取得良好的经济效益的同时，其生产的外部性效应日益凸显，集约化养殖不仅造成严重的环境污染，直接影响到居民生活质量与身体健康，而且也使得养殖场与周边村民的矛盾日益激化。
目前，我国养殖业广泛使用各种抗菌促生长剂，种类繁杂、剂量过高，并缺乏禁药期的严格管理，使这类抗菌促生长剂不仅在动物体内大量残留，而且其残留引起的细菌抗药性日益增强。违禁添加的动物抗生素、人用抗生素也让动物产品的安全变得无法保证。肯德基问题鸡肉事件就是养殖业主为了追求经济效益，超量或违禁使用药物导致食品危害人类健康的典型案例，这些现象在我国还较为普遍，严重危害到人们的健康和行业发展。
2 、生物发酵在动物生产应用的近况
现阶段的生物发酵技术，在中国饲料添加剂企业已经广泛应用，比如酶制剂、氨基酸、抗生素、益生菌等，但在养殖现场的直接应用尚处于初级阶段，主要有全价饲料、粕类饲料、纤维类饲料、秸秆类饲料、养殖垫料等发酵技术。目前在养殖现场应用比较多，养殖户比较接受的有发酵全价饲料、秸秆类饲料以及发酵垫料。常用的菌种有乳酸菌、酵母菌、芽孢菌、各种曲霉菌等。
2.1 发酵全价饲料
将全价料包括能量、蛋白原料、矿物元素等全部饲料成分作为底物，或者直接用市售全价饲料作为底物，在适当的温度下经厌氧或好氧短时间发酵，改善饲料的适口性，提高采食量，该类饲料不仅能全面满足动物的营养需要，还能增加多种消化酶、有机酸、维生素、多肽、小肽、氨基酸的含量，富含大量的益生菌。
目前国内生产这类菌种的厂家很多，发酵模式包括自产自销、自产自用等，但是都存在着不同的瓶颈问题。自产自销，如果烘干存在费用加大、成本升高的问题，湿料则受到气温、运输、包装、染菌等各方面问题影响，销量有限。自产自用解决了以上问题，发酵完毕即可使用，但是存在规模小、批次之间不均衡、工艺不稳定、易霉变等问题。这些都是生物发酵在饲料企业转型路途上的需要解决的难题。